时间:2022-08-04 21:39来源:财神爷站
今天分享的软件是Evolview——一款强大的进化树在线编辑软件。它可以制作出高颜值的进化树,并且提供17种示例树,以及5个具体项目示例。
它还可以导出多种格式的文件,包括pdf、svg、tiff、png,而且绘制完成的进化树可永久性的保存在网站里,也可进行共享。下面我们就来介绍一下Evolview的使用方法:
一、生成物种树
网址://www.evolgenius.info/evolview/#login注册账号,登录:操作栏共分四栏:基础、高级、注释与导出首先,把树上传上传之后,可以把树导出为svg的矢量格式可以选择物种树的表现形式:进化分支图(不带枝长),系统发生图(带枝长)、斜向进化分支图、圆形进化分支图、圆形系统发生图
(进化分支图)
(系统发生图)
(斜向进化分支图)(圆形进化分支图)(圆形系统发生图)更改枝的边角圆角斜角网页模式,字体变小?显示支持率、支持率斜体与字体大小?显示枝长、枝长斜体与字体大小?显示物种名方式?放大缩小选项?图像占屏幕比例?扩展与压缩图像?物种名字体?枝的粗细?调整角度?开始注释?由于图片数量限制,更全图标解读含义可在公号科研日精进内查看。
示例树和具体项目
此外,网站还提供了17种类型的示例树,以及5个具体项目示例。
1.?yeast?duplications(饼图)Duplication(两种颜色)overlap?with?WGD(两种颜色)overlap?with?other?duplicates(四种颜色)pie?with?strokes(加圆圈)pie?with?data?values?shown(显示具体值)
2.?ensembl?compara?2011(分枝颜色)Branch?Colors(分枝颜色)
Mouse(物种名内圈颜色)back?ground(物种名内圈颜色)Charts(物种名外圈颜色)3.?a?demo?of?datasets(叶片颜色)branch?colors(分枝颜色)leaf?colors(叶片颜色)leaf?background?colors(叶片背景色)bars(条形图)color?strips(多边形)
4.?bars(条形图)bars1(条形图1)bars2?with?data?shown(条形图2显示数据)5.?leaf?decoration?and?stroke(叶片装饰)leaf?deco?and?stroke(叶片装饰1)
leaf?deco?and?stroke(叶片装饰2)6.?protein?domain(蛋白结构域)7.分组标签1、2branch?color?to?root(到树根的颜色)leaf?colors(叶片颜色)style?5(树枝分组)
style?2(叶片分组)
default?style(附加分组)
8.?group?label?style?3(分组风格3)
9.?group?label?style?4(分组风格4)
10点状图with?strokes(圆形带圈)rect?without?strokes(正方形不带圈)11.热图
12.列状图
13.bootstrap值bootstrap?1
bootstrap?2bootstrap?3bootstrap?4bootstrap?5
bootstrap?6
14.物种名
15.多bootstrap值
16.时间轴
17.网页模式leaf?label?green
leaf?label?pink
好了,以上就是使用使用Evolview对系统发育树进行美化操作。